ตามที่รัฐบาลได้มีการจัดตั้งกระทรวงการอุดมศึกษา วิทยาศาสตร์ วิจัยและนวัตกรรม(อว.) ซึ่งส่งผลให้สำนักงานคณะกรรมการการอุดมศึกษา(สกอ.)ต้องยุติบทบาทลง และให้โอนย้ายหน่วยที่เกี่ยวข้องซึ่งรวมถึงมหาวิทยาลัยต่าง ๆ ที่สังกัด สกอ.เดิม ไปอยู่ภายใต้ อว. นั้น ผู้สื่อข่าวรายงานว่า ขณะนี้ได้เกิดสุญญากาศในการทำงาน ในช่วงเปลี่ยนผ่านการบริหารงานของ สกอ.ที่ย้ายมาสังกัด อว. ซึ่งทำให้ภารกิจต่าง ๆ เกิดความล่าช้า เช่น การรับทราบและเห็นชอบหลักสูตรของมหาวิทยาลัยต่าง ๆ รวมทั้งงานของสำนักส่งเสริมและพัฒนาสมรรถนะบุคลากร สำนักมาตรฐานการอุดมศึกษา และ สำนักนิติการของ สกอ.เองก็มีเรื่องค้างอยู่จำนวนมาก
“ตอนนี้มีงานที่ สกอ.ต้องเร่งดำเนินการ แต่ต้องหยุดชะงักไว้ก่อน เช่น การสอบสวนวินัยที่ยังค้างอยู่อีกหลายคดี การเสนอรายชื่อบุคคลขึ้นทูลเกล้าฯแต่งตั้งในตำแหน่งต่าง ๆ หรือ การรับทราบและเห็นชอบหลักสูตรการเรียนการของมหาวิทยาลัยต่าง ๆ ที่ผ่านสภามหาวิทยาลัยมาแล้วอีกเป็นจำนวนมาก ซึ่งจะส่งผลกระทบต่อการจัดการศึกษาของมหาวิทยาลัย”แหล่งข่าวกล่าว